Нужно будет использовать npn транзисторы, которых германиевых мало, по-моему ГТ402 как раз такие. И, кстати, для фуззостроительства они очень неплохи. А если будешь применять кремниевые транзюки, то потребуется конкретный пересчет режимов, благо для ФФ есть специальный калькулятор, да и hfe кремниевых транзюков измерять не в пример проще. И, соответственно, звук поменяется.
Только зачем это тебе? Если представить минус в схеме с нормальной полярностью и плюс в схеме с обратной полярностью неким нулем, то будет совершенно ясно, что никаких проблем не возникнет, т.к. по сути, включая примочку с обратной полярностью питания и примочку с прямой полярностью, мы получаем своего рода два плеча питания с общим нулем. Соответственно коротких замыканий не будет, если только не соединять минус обратнополярной с плюсом прямополярной. Обратнополярное питание только поначалу смущает.