Stygian,
Плюсы железа - меньше задержка.
На компе многое зависит от аудиоинтерфейса, задержка всегда выше, но на компе, в-принципе, нет никаких ограничений по длине импульса, опять-же любой сэмплрейт.
Алгоритмы могут быть и одинаковыми, хотя на компе обычно используют более сложные варианты чтобы работать с большими длинами импульсов (в лучших случаях, естественно).
В простых железках могут обходится стандартной функцией конкретного DSP и поэтому длина небольшая, порядка 20 мс, что маловато...
В недорогих железках могут использовать конвертеры попроще или вообще то, что интегрировано в чип, показатели у такого обычно довольно скромные.
С железом, если нет полностью цифровой коммутации (на вход цифра и забираем по цифре) ещё добавятся фильтрация обвязки конвертеров, так что побитной идентичности не будет, даже если алгоритм одинаковый.