Кусачки, думаю, возьмут, если нормальные. Мы с товарищем так укорачивали болты из Метизов для сёдел Эджа, поскольку у родных резьба была сорвана. У датчика, вроде, даже помягче материал.
Что касается звука: тут я, конечно, - абсолютный дилетант, но мне пришли в голову SSL-4 Ричи, нашего, Блэкмора. По меркам сингла датчик весьма и весьма мощный, серединистый. А магниты там по диаметру здоровые. И явно это не просто так. У тебя, конечно, магнитоводы увеличены в другой проекции, но есть вероятность, что смысл тот же. Уверен, что на звуке сказывается + такие серьёзные производители просто так не станут менять на одной из моделей длину магнитов, если это не скажется на звуке. Поэтому надо делать лишние дырки в гитаре или подумать относительно других пикапов.
P.S. Теперь, покупая датчик на вторичке, надо смотреть - не пилили ли там магниты?